《星际之门：亚特兰蒂斯第1季》剧情简介第1-20全集大结局
星际之门：亚特兰蒂斯第1季/Stargate: Atlantis Season 1 剧情分集介绍：第十三集剧情
科学家们在搜索 Atlantis 城区的时候，在一个病毒实验室发现了一些破碎的容器，然后队员们相继开始出现鬼魂的幻觉，6个小时后导致脑动脉破裂而死。一个病人由于过度的惊吓在城区四处乱窜，Atlantis 全面戒严。
然而6个小时过去后，McKay 却并没有死亡，原来是他体内的古人基因保护了他（他第一个接受了基因改造），在显微镜下，Carson 发现它是一种专门用于杀死普通的人类的纳米病毒（纳米机器）9悦网剧情jyuew.com。但是现在只有 48% 的人有条件接受基因治疗，所以更有效的办法是制造一个强电磁脉冲（EMP），消灭所有的纳米机器。于是 Sheppard 带着一个 Naquadah 发电机飞到城市上空 20 英里处引爆，爆炸产生的 EMP 消灭了病毒。
既然幽灵需要吸食人类的生命维持自己，所以病毒不会是他们弄的，那么到底是谁制造了这种可怕的东西？
星际之门：亚特兰蒂斯第1季/Stargate: Atlantis Season 1 剧情分集介绍：第十四集剧情
Jumper-1 被一群幽灵战机追赶，突然下面的星球上发出一束亮光，亮光摧毁了幽灵战机，Jumper 却安然无恙。McKay 认为只有 ZPM 才能为这样强大的武器提供能源，建议下去调查一下。 一个叫做 Zarah 的修道士代表 Proculus 人欢迎了他们，他们从未遇到过幽灵，Athar 神一直在保护他们。McKay 认为有一个他们不知道的古人武器在保护这个星球，不过这里倒是 Atlantis 的最佳避难所。Zarah 带他们去见女祭司 Chaya 以征求神的意志，Chaya 很遗憾地说 Athar 神不能让非子民在此居住，不过她很希望去参观一下神奇的 Atlantis。
Carson 检查了 Chaya 的身体状况，发现她的健康状况非常完美，完美到没有任何缺陷。同时她还无意中激活了新近发现的一个古人装置，说明她可能有古人基因，或者说该装置是用于检测城中的外星（外族）人的。这些引起了大家的警觉，McKay 劝告 Sheppard 不要“打 Chaya 的主意”，不过 Sheppard 却已经和 Chaya 成了亲密的朋友。
Chaya 承认她是一个古人，来 Atlantis 的原因是因为被 Sheppard 所吸引（X_|||），现在幽灵即将袭击 Proculus，她必须回去救他们，然后变成能量团穿过了星门。Sheppard 驾驶 Jumper 赶去协助 Chaya，不过她轻易地就消灭了幽灵。原来她因为违反升天规则帮助了 Proculus 人，被罚永远留在那里保护 Proculus 人——但是不能帮助其他人，所以不能为 Atlantis 提供避难所。