《旗舰》分集介绍（1-34全集）大结局
于季东闻讯，带着钱赶到省城医院，但受伤渔民不要钱，他要求舰艇学院免考招收自己儿子入学，不然就要求学院将郑远海除名。
舰艇学院对受伤渔民的前一个要求无法接受，只能考虑把郑远海出名了，陈建军紧急报告基地，鲁淮成赶到舰艇学院，拜见了自己的老同学，舰院院长，强调郑远海是个不可多得的人才，希望学院能网开一面，并亲自到医院慰问受伤渔民，最终受伤渔民同意收回条件，事情圆满平息。郑远海得以继续自己的学业。
一天，舰艇学院研究班和军医大学女学员一起完成一次海上救护的演练。郑远海和梅杏儿被分配到一艘救生艇上，两人相见分外惊讶和兴奋，以至怠慢了演练的任务，当秦思婷在另外一条救生船上招呼他们，两人才醒过神来，这时别的学员已经将海上置放的假伤员都收到自己的艇上，只剩一具假伤员远远漂在海上，郑远海和梅杏儿决定不管多远也要把“伤员”救上来。他们朝远处划去。
岸边，教官对郑远海不放弃一个战友，伤员的行为表示赞赏，大家休息等待。
海上，那具“伤员”越漂越远，橡皮艇上的郑远海和梅杏儿奋力朝“伤员”划去。
岸边，秦思婷有些不安地看着海上远远的小点。
《旗舰》分集介绍：第七集
郑远海和梅杏儿终于将“伤员”抬上橡皮艇，这时，他们离海岸已经很远了，梅杏儿有些恐惧地看着黑云压城的大海告诉郑远海，听说有鲨鱼在这一带出现，郑远海告诉她，救生衣下面有防鲨装置，可以躲避鲨鱼的侵袭。
岸边，人们已经看不见海面上的橡皮艇了。秦思婷听说今天傍晚有暴风雨，更是担心起来。
在郑远海和梅杏儿准备往回划的时候，鲨鱼出现了，它朝他们冲了过来。
晚上，海上几艘舰艇开着探照灯在寻找。
郑远海和梅杏儿的失踪，惊动了舰艇学院和军医大学的领导，双方领导开始布置了紧急寻找方案。
清晨，一个荒岛的沙滩上，梅杏儿醒来，她看着这陌生的环境，哭了起来，郑远海则安慰着她，他拿出医药箱里面的放大镜，利用阳光点燃了篝火，利用针头和鞋带在礁石旁钓起了鱼。篝火旁，两人吃着烤鱼，畅谈着天上的星星，彼此都产生了喜爱。
就这样，郑远海开始用自己曾经野外生存过的经验实践了小岛生存，经过经过了三天三夜，他们终于被海航的直升飞机发现。
心情焦急，不吃不喝的秦思婷看见他们平安的返回时，激动地扑向郑远海，把他紧紧抱住，她这时才感到自己深深地爱着郑远海。
怀才不遇的谢庭群听说陈建军的父亲是他的老乡，提着两瓶药酒，以老乡的身份来到了陈敬国家，使得陈敬国对他颇有好感。
郑远海两年研究生毕业回到基地，满心欢喜地以为可以上舰了，但鲁淮成将一堆书放在他面前，命令他一年内熟练地掌握法语，郑远海呆了。