《神医将军》分集剧情介绍（1-33全集）大结局
侯七等人就要杀狼狗时，廖廷荣及时赶到，抓着他们去找王怀远问责，王怀远狡辩，赵化民也有意偏袒王怀远，廖非常不满。田麦穗身为教导员也及时的提出二大队人的一些纪律问题。
通过田麦穗的帮助银杏参加了医疗队，但是面对侯七的求爱，因为自己的经历银杏再次拒绝。
王怀远跟廖廷荣进行一场立功竞赛，看谁先拿下据点。
《神医将军》分集介绍：第二十九集
王怀远为拿下豹头寨广散英雄帖，丁五、满天红从中牵线，借助当地积极抗日分子苗铁胆的青帮势力，联合起来一起攻打金水城。廖廷荣不满都是土匪的做法，与王怀远对着干，半路绑了苗铁胆，使苗铁胆跟王怀远闹翻。王怀远不服，要收拾廖廷荣，被田麦穗阻止。
侯七偷了苗铁胆身上的青帮信物，以青帮身份混上豹头寨说服占领豹头寨的伪军贾贵发。王涌泉也赶到金水跟宋文清汇合，也想拉拢当地的青帮势力。就在侯七说服贾贵发准备离开时，正好遇到王涌泉也来说服贾贵发，后期说服了涌泉在日军面前先放下个人利益，众人一起击溃了豹头寨上驻守的日军。
佐藤和田大棒子得到消息赶往豹头寨支援，王怀远自制了一批中药炸弹，埋伏在日军行军途中，令日军中弹后奇痒难忍，大败而退。侯七为了保护银杏，中了日军的手榴弹，身负重伤。
日军伤亡惨重。但阴雨天气药品紧缺，八路军的伤员也同样面临伤势感染，药品紧缺的问题。
《神医将军》分集介绍：第三十集
王涌泉被日军俘获，王怀远得知后，派人营救涌泉，但却因为关押严密无法下手。薛参谋答应帮忙找出王涌泉关押的地点。
因为队伍里药品稀少，王怀远借用《火器医鉴》上的针灸术，治好了侯七在内大部分的伤员。俘虏来的日军里也有同样病症的伤员，王怀远也将其治好。王怀远派人故意放了一个用《火器医鉴》上方子医好的日本俘虏。满天红跟丁五在金水城找到他们早年在皇协军安插的卧底薛参谋，佐藤出条件用《火器医鉴》作为交换王涌泉，王怀远只好答应三天之后交换人质。薛参谋给佐藤带回了一个《火器医鉴》上的方子让佐藤一试真假，佐藤俊二看到受伤的日军士兵回来后伤愈，非常震惊，薛参谋带回的药方也见效，才放心交换出王涌泉，然后让日本军医按照药方给日军伤员治疗。佐藤明着与王怀远换书，暗地派人埋伏，宋文清也带着人埋伏，在半路涌泉就被宋文清劫走。谁知王怀远只给日军治了一半的伤，非但不会痊愈，反而会造成慢性中毒，使得日军伤员大量死亡，佐藤俊二气极。
拷打过薛参谋之后，薛参谋供出他跟丁五和满天红早有联系的事，刁四带人逮捕丁五和满天红，佐藤俊二让红家班继续演出，然后将丁五和满天红在内的红家班的人全部杀死在舞台上。
日本战败，日军投降，佐藤俊二却剖腹自杀，死在《火器医鉴》面前。