文森的再次归来，在初期还算安定，但是Proxy One却在暗中促使AR自我觉醒。此时的文森并不知道自己的Proxy的身份,Proxy One也就是借此机会，唤醒了Monad Proxy(Proxy One这样做的目的，就是要趁文森还未发觉自己是Proxy时，借文森的手，杀掉Monad)。觉醒的Monad Proxy感知到了文森的存在，同时她也感知到了自己的克隆体莉露的存在。第一话中，文森化为Ergo潜入莉露的闺房，其动机只是为了保护莉露，但是Monad在这个时间的出现，使得文森误以为Monad要杀掉莉露。Monad并不想与文森战斗，因为她很清楚现在的文森处于失忆状态，所以她想接近文森，唤醒他失去的记忆。但是，一心想成为良好市民的文森，在极度的恐慌中，失手将Monad杀掉。Proxy One的目的达到了，搅局的Monad终于死在了文森的手里。这样,Proxy One本已失败的计划又能换种方式，顺利的进行了，先将文森赶出Romudo,然后利用文森的复仇心理，对Romudo进行毁灭性的报复，通过这种报复，来满足自己对制造Proxy的人类的惩罚！

　　本来,Proxy One的计划是天衣无缝的，但是莉露，皮诺的出现扰乱了一切！在Commue,Queen等人的阵亡，让文森深信，只有找到自己的过去，才能将所有的真相揭开。之后，文森与皮诺在旅行中，相继遇到了月光，光辉两个Proxy,在他们身上，他感到了身为Proxy的孤郁。光辉与月光，因契约而死。说的直接点，是因孤独而死，因孤独，而产生了对人类的憎恨。他们是可悲的，因为他们不仅不能和人类融洽，而且也不能与AR良好的共同生存。皮诺对光辉的厌恶，就可以说明，在光辉眼里,AR只是利用的机器，用来毁灭人类的机器。这段遭遇，使得文森对发生在自己身上的一系列怪事，有了更进一步的理解。也使得文森与皮诺之间的旅行朋友关系上升为了生死与共的亲密无间的伙伴关系。

　　之后，文森在自己的记忆中的挣扎，让他本人认识到了，自己就是Ergo,Ergo就是自己，是不可能将这两者分开的。也在这个时候，莉露再次出现在文森的眼前。莉露此时的使命，就是将文森带回去，而且与她同行的还有早已被Cogita病毒感染的AR尼基（莉露身上还带有两枚能杀死Proxy的光弹）。在一片废弃的森林中，四人相继发现了神秘AR,神秘Proxy,神秘的洞穴。文森为了保护莉露，与神秘Proxy大战，但最终，莉露射出的光弹，杀死了神秘Proxy！随即，莉露决定于文森同行，去发现真实，而尼基则被莉露强制性的命令回Romudo。已经觉醒的尼基，只是想与莉露在一起，他并不愿意觉醒，而是盼望这象在Romudo一样，时时刻刻陪伴在莉露左右。觉醒的思想不断和过去的记忆产生着冲突，这样的结果直接导致了尼基走上了不归路。但最终，尼基为救莉露惨遭炸弹炸死。（尼基在神秘山洞中看见的东西，就是人工母体，他也许是第一个知道 人类是由Proxy制造 的AR)

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