同一时刻，前来接收高达的大天使号的残余人员在娜塔尔少尉的带领下，启动了大天使号；得知消息的穆也回到了赫利奥波利斯的内部对大天使号进行援护。大天使号与ZAFT军就在殖民地卫星的内部展开了激战。

《机动战士高达SEED/高达》剧情介绍　第三话：崩壊の大地

　　在与ZAFT军的拉乌激战的时候，吉良驾驶强袭高达将赫利奥波利斯的壁轰开了一个大洞。惊讶于强袭高达的威力的拉乌选择了撤退。吉良等人登上了大天使号。正当众人惊诧于驾驶强袭高达的吉良只是个孩子的时候，穆看出了吉良是新人类。感觉到高达的威胁的拉乌选择了再度攻击大天使号，阿斯兰也驾驶着刚强夺来的圣盾高达随队一同出击。由于操作系统被吉良修改过，其他人根本无法驾驶强袭高达。随着敌人的临近，已决定不再驾驶高达的吉良不得不再度出击。吉良与阿斯兰，曾经的朋友在战场上再次相逢。激烈的战斗中，早已伤痕累累的赫利奥波利斯开始解体。

《机动战士高达SEED/高达》剧情介绍　第四话：サイレントラン

　　带着赫利奥波利斯解体时逃出的一艘救生舱，吉良回到了大天使号上，吉良等人的同学芙蕾也在这艘救生舱里。大天使号选择前往友军的军事卫星阿尔特弥斯要塞；但这个行动被拉乌识破，并针对大天使号的路线立下了行动方案。作为友人，阿斯兰一心希望吉良能回到新人类这边来，因此对于拉乌的质问，他的回答是将说服吉良。

　　被识破计划的大天使号遭到拉乌队的夹击。为了减轻吉良的负担，多尔等人志愿来到舰桥协助玛琉等人工作。被朋友们的行动及穆的言语所触动的吉良，决定继续驾驶强袭高达作战。

《机动战士高达SEED/高达》剧情介绍　第五话：フェイズシフトダウン

　　在强袭高达面前出现的是被夺走的四架高达。混战中，先行出击的穆出其不意地袭击了ZAFT军的威萨利乌斯号，但伊扎克和迪亚克无视撤退命令，继续攻击吉良。能量消耗严重的强袭高达解除了相转移装甲，危急中，圣盾高达变形为MA形态强行将强袭高达带走。在穆的援护下，强袭高达利用换装补充了能量，艰苦地将伊扎克等人击退。

《机动战士高达SEED/高达》剧情介绍　第六话：消えるガンダム

　　艰难地摆脱了ZAFT军的追击的大天使号逃入阿尔特弥斯要塞，然而在这里等待着他们的是友军士兵的枪口。虽然同在地球联合内，但玛琉等人所属的是大西洋联邦，而阿尔特弥斯要塞则是欧亚联邦的势力范围。想要获取高达的机密的阿尔特弥斯要塞司令加尔西亚软禁了大天使号上的成员。克鲁泽队的尼科尔利用自己驾驶的迅雷高达特有的“海市蜃楼系统”破坏了阿尔特弥斯要塞的全周围光波防御带发生系统，吉良趁隙驾驶强袭高达出来迎战。但决战高达及暴风高达此时已开始对要塞展开攻击。在大天使号逃离之后，曾经夸称“难攻不落”的阿尔特弥斯要塞开始崩坏。

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