《数码宝贝第3部》分集剧情简介第1-51全集大结局
另一方面，摩虎罗原来是神将的一员，摩虎罗兽，牠取出宝玉，夺取了杀害。就在杀害要悲惨的崩溃时，山木独自留下。
毘羯罗兽注入了从天空的方格传来的可怕力量后，再次开始进攻。启人因基尔兽他们进化、变得很强而很辛苦，阿健说，启人和机械基尔兽的力量是共有的，而毘羯罗兽也再次向着他们朝来……
第二十四集 前进，数码暴龙世界
数码世界的出现，令到现实世界陷入大混乱。数码暴龙的灾害也成了国家的重大问题。山木看见这些新闻感到很失落。不过，丽花开导他说“有些事只有山木才能做到”。在绝望的深渊中苦恼的他的答复是……
启人他们为了解决这个事态，决心出发往数码世界。他们各自向家人介绍了自己的数码暴龙后，传达了将会在明日踏上旅程。
第二十五集 再见，我的家
启人他们进入了数码世界及其地带之中！一个用双筒望远镜便可看见一个反转的日本地图的世界！好不容易才到达的地方竟是一望无际的荒野。启人在那里竖立了一支旗。首先要找找看有没有人造的东西，用望远镜看见了一条类似天线的物体，便以此为目标步行。但这只是一堆岩石。而且那里还有野生数码暴龙的攻击！
第二十六集 强风谷的公公兽和婆婆兽
留姬、博和及健太被光吹飞了。不省人事、醒来后，看见现实世界球变得很细小。已经被吹飞到很远了。
附近有一些民房，但没有门及窗，屋盖低低的圆圆的。怎么看该也是为了对抗强风而设的。风又刮起，各式各样的东西被吹起，撞向房子。结果他们再次被吹飞，三人飞到了公公兽及婆婆兽这两夫妇所住的房子。就在大家把因强风而弄歪的门壁弄好时，公公兽及婆婆兽的大战开始了……
第二十七集 小妖兽进化，可怕的魔王堕天地狱兽
启人他们在找寻留姬等人，但即使去到哪里始终也找不到。就在这时，大耳兽发现了一条泥人兽的村落。
村落很荒芜，不知为何满地车痕。接着出现巨大的电单车，并冲向启人他们。这电单车不知为何没人在驾驶。电单车辘过泥人兽后，便离去了。
在启人他们的面前出现了泥人兽的族长，得知那巨大电单车已多次袭击这里。牠们想找驾驶电单车的人，但车上根本就没人……
另一方面小妖兽到了一个浓雾的世界。在那里出现了狛犬姿态的招杜罗兽，寻找想变强的人。虽然小妖兽齿口否认，但其实内心是很想的。招杜罗兽向小妖兽发放一道光，在那里有拍档2个小朋友……
在村落那里巨大的电单车又再次开始袭击泥人兽牠们了。
第二十八集 是敌是友，传说中的驯兽师秋山辽
留姬、博和、健太及妖狐兽在旗那里等待，但总是没人回来。留姬于是遗下博和及健太，走去找寻其它同伴。被遗下的2人感到不安，所以也追上留姬了。