《神医》分集剧情简介第1-24全集大结局
经过这一场变故崔莹的心境有了很大的转变，他不能忘记庆昌君为自己而死的事，更不能忘记恩秀现在还在奇辙身边的事实，他整理好心情去找恭愍王商量下一步的计划。崔尚宫建议恭愍王先从身边亲近之人下手，清理掉其中的奸细，这些奸细有奇辙的人也有赵日新的人。恭愍王念着赵日新跟随自己多年，本不愿动他，但是这赵日新太不知好歹，竟然私自收买禁军。恭愍王经过一番考虑准备先将恩秀请回来，这样也好跟王妃交代，崔莹便答应先去试一下恩秀的心意。崔尚宫担心崔莹对恩秀动情便去警告他，她明白恩秀已经被奇辙盯上，崔莹绝不能跟奇辙明里斗。崔莹答应她自己不会喜欢恩秀，她才放了心，将宫外的秘密组织鹰鹫帮的联系令牌交给他。
恩秀在奇辙家里待得很烦，她很想去见崔莹，奇辙想了想决定同她交易。他拿出一幅地图让恩秀告诉他元朝何事灭亡，之后是哪个朝代，版图又有多大，他想借此改变高丽的命运。恩秀说自己也不是很清楚，奇辙以为她是在敷衍自己，便说自己可以实现恩秀所说的民主制度，恩秀明白自己不能干扰历史，否则会出大事。奇辙让她告诉自己哪个国家会灭亡，哪个会建立，谁可用谁不可用，这样他就能把国家变得刚好，让高丽更加强大。就在奇辙逼迫恩秀的时候，崔莹突然到来，恩秀便匆忙去见他。
崔莹见到奇辙后只说自己是来取剑的，对恩秀视若不见，他说恩秀既然跟奇辙一起去上朝那就表示她已经决定留在这里。恩秀急忙说自己是被困在这儿，说奇辙想从自己身上得到东西，所以不会伤害自己。末了她告诉崔莹自己已经将庆昌君的遗体安置好，让他不用担心。崔莹离开奇辙家后便去找鹰鹫帮的人，跟他们对上暗号后他来到一座空宅院，突然遭到一群人的围攻，这些人便是鹰鹫帮的，而崔莹跟他们都是熟识。崔莹本来想离开宫里后便跟他们一起生活，现在只能来求他们帮自己辅佐恭愍王了。
崔莹走后恩秀再也忍不住待在这里的日子，她将东西收拾好准备离开，却被奇辙拦下，恩秀现在明白了自己手中最大的筹码，她用未来的知识威胁奇辙，让他对自己客气点。而奇辙也不是会被威胁的人，他直接派人将恩秀关起来。等奇辙回到屋里时见到崔尚宫正在等他，崔尚宫说王妃的病又变重了，要请恩秀回去为她治病，她知道奇辙不会放人便让奇辙跟着进宫，说王妃要单独与他谈话。其实这一切都是恭愍王与王妃共同设下的圈套，为了引奇辙入宫，恭愍王对于王妃如此支持他很感动。
等奇辙带着恩秀来到皇宫时，崔莹早已派人做好了准备。崔尚宫并没有带奇辙去王妃的房间，而是把他带去议政的朝堂，恭愍王正带着于达赤部队在等他们。崔莹突然出现说出请他们来的真实目的，原来是要审问庆昌君一事，崔莹说庆昌君是被恩秀带走要去天界治疗，后来被郡守私藏起来，还将那位郡守拉出来审问。崔莹问恩秀请她去给庆昌君治病的人是谁，恩秀本来不明白这一切的目的，突然反应过来便顺着崔莹的话承认是江华郡守请她去治病的。奇辙明白这一切都是针对自己的圈套，但他无话可说，只能闭口不言。崔莹又拿出一份郡守的账册，其实里面大量的钱都流入奇辙家，但他当然不会承认，只能舍弃郡守保全自己。恭愍王宣布处死郡守，并派人将恩秀带走。这一招不仅除掉郡守，还成功将恩秀留下来，奇辙可谓是赔了夫人又折兵。