《旗舰》分集剧情介绍（大结局）
陈建军面对郑远海深感内疚，终于挺身而出，承担了责任，转业回到了地方。梅杏儿感激秦思婷对她的帮助，知道秦思婷深爱郑远海，悄然离去。于季东向秦思婷表白遭到拒绝后，爱上了梅杏儿，不久，于季东公司财务出现危机，情急之下卷入了一起文物走私大案。郑秀竹历经千辛万苦终于知道了梅杏儿就是鲁淮成亲生女儿的线索，正当谜底即将揭开之时，突遭车祸陷入深度昏迷。
梅得贵病重，梅杏儿为了给养父筹集手术费，无奈接受了化迪公司董事长于季东的巨额资助，却陷入了一个巨大的圈套，深知秦思婷为郑远海而痛苦的梅杏儿最后被迫做出了嫁给于季东的决定。正当于季东催促她去登记的时候，鲁淮成发布了演习命令，梅杏儿做为医疗人员随舰出海。秦思婷把父亲留给她的钱交给郑远海替梅杏儿还帐，然后调回到了母亲身边工作。已经在缉私艇大队担任大队长的陈建军揭露了化迪公司黑幕，于季东受到法律制裁。鲁淮成顶住压力任命双学历的硕士研究生郑远海为海军新型驱逐舰旗舰舰长。
许欣芳被检查出患了绝症，为了不拖累儿子郑远海，也怕自己走后女儿无人照顾，决定和女儿一起离开人世。郑远海从海上训练归来母亲已经死去，而郑秀竹却在中药的作用下却奇迹般的渐渐苏醒。鲁淮成和亲生女儿梅杏儿相认，鲁淮成老泪纵横。中国渔船受到不明国籍的船只威胁，正当渔民们感到绝望之时，郑远海率驱逐舰赶到，渔民含泪高呼祖国万岁！中国海军万岁！
鲁淮成退休了，在梅杏儿的陪伴下来为即将率出访的郑远海送行，在郑远海指挥的旗舰带领下，特混编队消失在海平线上，留下了一条永不消逝的航迹……
电视剧《旗舰》分集介绍：