《孝庄秘史》分集剧情介绍（1-38全集）大结局
大玉儿不让多尔衮得知顺治上洪府求学之事，但消息灵通的多尔衮还是有所耳闻。孝端后身子一日不如一日，弥留之际，孝端后将治国重任交付大玉儿，并特意找来多尔衮，要他顾全大局。
为了能当一位好皇帝，顺治日夜苦读。大玉儿看在眼里，喜在心上，同时告知他一件大喜事，他就要大婚了。
《孝庄秘史》分集介绍：第27集
苏茉尔告诉顺治他就要大婚了，将来的皇后不是别人，正是他舅舅吴克善的女娜木钟。顺治一听急忙拒绝，但大玉儿告诉他已经定好了，不日，娜木钟就会进京。顺治神色立时极为冰冷，为什么任何事他都是最后一个知道？
多尔衮从何洛会处得知顺治爱的是宛如，为了巩固自己权力，他决定打破满蒙联姻，让顺治坚持自己的选择，令顺治十分吃惊，忙不迭欢喜答应。多尔衮又召来宛如的父亲鄂硕，要他女儿把皇上抓牢。不明所以的鄂硕既不敢得罪皇太后，又不敢得罪多尔衮，进退两难。回到家中再问女儿宛如，宛如却不承认认识什么皇上。鄂硕罚宛如去佛堂反省，不准外出。
顺治思念宛如，闻知宛如一家去了西山，带贴身太监小唐微服出宫，与宛如溪边相会，红叶传情，宛如犹如梦中，但仍不晓顺治真实身份。
为了压制顺治，多铎与何洛会进言，要多尔衮向两宫太后讨新称号，将“皇叔父摄政王”之尊号改为“皇父摄政王”。
此事引起满朝文武议论，想讨好多尔衮的钱谦益举出一堆道理，支持这个尊号，钱谦益与何洛会顺水推舟，鼓动多尔衮让大玉儿下嫁。
听到此消息，大玉儿大惊，苏茉尔连夜赶到范文程府讨计策。范文程建议大玉儿将计就计，并藉此牵制多尔衮。大玉儿表面顺从多尔衮，却引起顺治的反弹与误会。
《孝庄秘史》分集介绍：第28集
顺治方才明白，豪格的话都是真的，他怒极斥责大玉儿背叛了他和他皇阿玛！情势紧迫，顺治写信去向洪承畴求救，希望洪承畴能阻止大玉儿下嫁多尔衮一事。
顺治心烦不已，上汤若望处散心，竟又遇董鄂与孟古青。顺治向董鄂表白，董鄂也表露心意，正当两人互诉衷曲之际，小唐急报洪承畴进京求见，这才暴露顺治皇帝的身份。顺治不及向董鄂解释，董鄂怅然。
洪承畴向多尔衮呈上一首民间对于太后大婚一事的谤诗，告之此诗让朝臣议论纷纷，也坏了太后及大清的名声。
多尔衮见婚事告吹，心有不甘，与大玉儿发生口角。大玉儿见多尔衮心意坚决，便约多尔衮深夜见面，会给多尔衮一个交待。
深夜，大玉儿平民妆扮，并拿出一只已拟好宣告大玉儿薨逝的诏书给多尔衮看，与多尔衮相约，只要多尔衮放下一切权力，愿与他同赴草原共同生活，而这是唯一能顾全大局，又成全两人感情的方式。
多尔衮思考良久才答应大玉儿的要求，但大玉儿却又拒绝了多尔衮，她告诉多尔衮，二十年前的多尔衮绝对会毫不犹豫地答应，现在的他早已不是二十年前的多尔衮了，除了爱大玉儿，更爱上了权力。对此质问，多尔衮黯然长叹，玉儿，你总是对的，说完落寞而去。