《旗舰》分集剧情介绍第1-34全集大结局
梅杏儿送父亲梅得贵回乡，在车站看见了于季东接一个客商，这位客商一眼看中梅杏儿，提出要梅杏儿陪他喝酒，否则不签合同，于季东坚决不同意，结果助理林雪还是把梅杏儿带到了酒桌前，客商高兴地在合同上签了字，于季东拿起合同，拉起梅杏儿离去，使客商什么也没捞着。
鲁淮成被任命东江基地司令职务，他组织基地各舰海上实弹打靶演习，陈建军凭着经验在靶船还没出现的时候，就锁定了射击方位，郑远海觉得这样做不是按实战要求，陈建军不以为然，两人产生分歧，他告诉郑远海还嫩，要想跟自己对话还需要十几年的实践经验。结果陈建军果然首发命中靶船。
电视剧《旗舰》剧情分集介绍：第十八集剧情
陈建军的186舰在实战演习中名列第一，受到了基地的嘉奖，他得意忘形在舰上大摆宴席，喝酒庆贺，郑远海和政委采取了相应措施，使喝酒官兵减少到最小限度。夜深人静的军港突然响起了战斗警报，鲁淮成发奖状是放的烟雾弹，突然发出战斗警报才是真正的用意。
结果陈建军大醉昏睡，郑远海果断地担负起指挥任务，基地发来指示，对海上标靶实施导弹攻击，目标自行搜索。雷达显示，夜海上除了有两艘渔船在航行外没有发现靶船出现，郑远海警惕地意识到，打靶戒严区不可能有渔船出现，一定那就是标靶，当郑远海紧急准备锁定两艘渔船实施导弹攻击时，传来基地停止攻击的命令。
所有各舰均未对活动的标靶实施攻击，鲁淮成严厉批评了各舰舰长，没有实战意识，只会打死靶，不能认清活靶，宣布所有舰艇均为烈士，特别是陈建军的庆功喝酒，被鲁淮成命令深刻检讨，听候处理。
陈建军误以为是郑远海的汇报，才使鲁淮成启动的深夜行动，由此两人矛盾加深。
郑远海陷入痛苦，当梅杏儿来电话希望一起看电影也被他拒绝，鲁淮成看出问题，他告戒郑远海派他到186舰与陈建军合作，主要是让他丰富经验，不能搞不团结。
于季东因为被秦思婷拒绝，一气之下开车狂奔，造成车祸，住进了医院，梅杏儿代替值班的秦思婷前去探望，深感于季东对秦思婷的深爱之情，当她再次劝慰秦思婷答应于季东时，秦思婷终于说出他心里是郑远海，梅杏儿呆住了。
电视剧《旗舰》剧情分集介绍：第十九集剧情
梅杏儿万万没想到自己心底相爱的人，也是秦思婷所爱的人，善良的她选择了回乡探亲，忍痛把时空留给亲如姐妹的秦思婷，她觉得自己欠她很多很多。
政委王宏业北京开会回来，带来了更新的大型驱逐舰188旗舰年底就要列装的喜讯，鲁淮成决定要提速培养年轻干部，他搞了个“希望工程”，对郑远海，南克江这样年轻有为的干部进行强化培训，使他们能迎接掌握更为高科技化的未来舰艇的到来。
这时，郑远海的母亲许欣芳胃炎住院，秦思婷为了不影响郑远海训练，她白天黑夜地扶持在许欣芳身边，使得许欣芳喜爱万分。当着探亲回来的梅杏儿大谈秦思婷的好，觉得与郑远海也般配，搞得梅杏儿很尴尬，她借故逃出病房。