《太祖秘史》分集剧情介绍（1-46全集）大结局
代善很敬佩皇太极在处理舒尔哈齐一事的智慧，并向皇太极诉说自己受母亲冷落的苦衷。皇太极却说努尔哈赤冷落褚英的原因是舒尔哈齐死后没人能够牵制褚英了，代善仔细思考着皇太极的话。
努尔哈赤教多尔衮练武，阿巴亥说起多尔衮要到军中效力，受到褚英冷落的时候，努尔哈赤非常生气，努尔哈赤透露不想让褚英继承汗位的想法。这时五大臣求见，努尔哈赤当即猜到他们是来为褚英求情。五大臣是想让努尔哈赤继续放权给褚英。努尔哈赤却明言他想另立储君，因为褚英杀了舒尔哈齐。佟佳氏怪五大臣太草率，他们说要联名上书为褚英讲情。佟佳氏非常感动，但仍旧要求他们不要太冲动，要等待努尔哈赤回心转意。
佟佳氏问褚英到底是为了救父亲还是为了自己，才杀舒尔哈齐的？褚英用死来保证自己是为了父亲。佟佳氏说，只有你能继承汗位，你才对的起你的祖爷爷，才能让五大臣的权利和地位继续有保障。褚英打算用武力来威胁努尔哈赤退位。他永远忘不了母亲当初烧掉佟家庄园的情景，他觉得如果要没有母亲带着五兄弟来到建州，就没有努尔哈赤的今天。
《太祖秘史》分集介绍：第38集
佟佳氏生日大摆筵席，朝中重臣都来道贺，她的地位极为尊贵。晚上佟佳氏为褚英求情，努尔哈赤冷冷地说：我的儿子谁都有可能继承汗位就不能是褚英。佟佳氏质问努尔哈赤，如今对褚英的态度是否和当初她赶他出佟家庄园有关？佟佳氏告诉努尔哈赤，只要褚英继承汗位，自己可以死，努尔哈赤终于答应佟佳氏让褚英出应继承王位。佟佳氏嘱咐褚英将来继承王位以后要尊重父亲爱护弟弟，永远把五大臣当做自己的父亲来看。她要把褚英永远记在心中，她也去看了代善，回到宫中她换上华丽的衣服见了五大臣，要他们永远像效忠她那样效忠汗王。
佟佳氏为了保住褚英的储君地位，用一条白丝带承载着她对儿子深深的爱与希望离开了人世。努尔哈赤默默地看着死去的佟佳氏，他的一切梦想、成功光荣与屈辱都是和她联系在一起的，如今他仍旧想深情地叫她一声“大小姐”。
努尔哈赤举行隆重仪式，正式立褚英为继承人。代善显得神情沮丧，他就是想不通母亲为了褚英居然能牺牲自己的性命。代善听从了皇太极给他的建议，告诉褚英努尔哈赤早就知道他母亲要死，可他并没有阻止。另外造成母亲自尽的主要原因还有五大臣的威逼，他们希望通过褚英掌握朝中大权，褚英激动地要找五大臣算帐。褚英是下定决心要与五大臣翻脸了。
《太祖秘史》分集介绍：第39集
在朝堂上褚英对五大臣的意见都予以否决。开始五大臣并未多想，可到后来褚英不断和他们作对，并且把权利都逐渐给了四大贝勒， 五大臣感到事关重大，又怕禀报努尔哈赤以后，危及褚英的地位。
努尔哈赤了解朝堂里的情况，五大臣多有顾虑，只说褚英的好话，这激怒了努尔哈赤，他告诉五大臣包庇褚英就等于害了他，五大臣面面相觑。此时，褚英在努尔哈赤心里的地位，已经被动摇。五大臣极力想维护褚英和努尔哈赤之间的关系，褚英却以在努尔哈赤面前告状为名，狠狠地呵斥了五大臣，五大臣敢怒不敢言。