《大明医圣李时珍》分集介绍（1-47全集）大结局
太子在册封大典时因服用丹药而亡。李行义按舅舅老焦的苦肉计供出道长和老焦，道长和老焦被处死，李行义赢得嘉靖信任，被提升为道长。杨雪英为嘉靖怀上龙种，被皇上册封为敬妃。不料遭情同姐妹的张惠妃暗害，杨雪英流产，从此被嘉靖冷落。
《大明医圣李时珍》分集介绍： 第二十集
又是十几年过去了，已经三十多岁的李时珍告别父母妻儿，来到楚王府担任奉祠正一职，因为治好了楚王儿子的怪病，得到楚王的赏识。
李时珍为了完成修本草大业，请求楚王推荐自己进太医院。楚王答应了，推荐李时珍进京报考太医院，并告诉他考太医院要过严世蕃这一关。
李时珍来到京城，在高拱府上找到了父亲的旧友太医院院使徐长明，并与徐长明一道为高拱诊断出多年的顽疾，深得高拱赏识。李时珍在高拱的引见下拜会了裕王，裕王乐意推荐李时珍进太医院。李时珍的推荐信经杨洪勤之手送到严世蕃手上，严世蕃气急败坏，暗示杨洪勤在考场上好好“对待”李时珍。
《大明医圣李时珍》分集介绍： 第二十一集
太医院考场上，李时珍第一个交卷，杨洪勤正欲做手脚，恰好徐长走进考场，表示要与杨洪勤共同监考。前面各科考试李时珍考试成绩均在第一，但最后一轮辨药考试中，因为杨洪勤偷梁换柱，使得李时珍中计失误。李时珍的名字被严世蕃从考生中划掉。后来，因为裕王和高拱出面力保李时珍，严嵩为了平衡各方势力，命杨洪勤将李时珍录取为太医院实习医师。李时珍终于如愿进了太医院。
接着，被录用的实习医师们在杨洪勤的带领下熟悉每一项宫廷礼仪和太医院的规矩。在实习过程中，李时珍虚心求教，隐忍苦学。
《大明医圣李时珍》分集介绍： 第二十二集
嘉靖授意李行义给张惠妃服食一种强身健体的丹药。杨敬妃为了复仇，与李行义密谋决定在张惠妃的饮食中做手脚，让丹药和饮食相冲，使张惠妃生发毒疮且皮肤变得粗糙。疮毒怪异，太医无人能治。
太医院有规定，实习生犯小错两次，大错一次将被逐出太医院。杨洪勤为赶走李时珍，决定让李时珍为张惠妃治病，徐长明想制止却没有成功。可没想到李时珍不负众望，治好了张惠妃的病，打破了杨洪勤的如意算盘。嘉靖要奖赏给张惠妃治病的太医，杨洪勤却说是太医院集体的功劳。徐长明按张惠妃的意思安排杨洪勤告假，而让李时珍做了她的主治医官。
《大明医圣李时珍》分集介绍： 第二十三集
李时珍治好了张惠妃的病并用水果汤汁等办法使惠妃恢复了往日的容颜，之后，李时珍还查出了毒疮的病因是张惠妃服食的丹药和近期食用鹿肉相冲，不禁心生疑惑。就在这时李行义约见了将李时珍，兄弟俩相见，悲喜交加。李时珍抱怨李行义既然还活着，为什么不让家人知晓，李行义以自己伺候在皇上身边随时会有不测，不想让家人再一次为自己伤心加以搪塞。李时珍不再计较，却质问惠妃娘娘的丹药和饮食，李行义承认是自己大意并要求李时珍为此事保密。李行义嘱咐李时珍不要让他人知道他们之间的关系，这让李时珍很是不解。