《潜伏间谍》分集剧情介绍（1-32全集）大结局
秦文廉无意中陷入政治漩涡的中心。
江虹命令方滔和慕容无瑕以恋人的身份渗透到慕容无瑕父亲慕容闻的身边，以便更好地了解日军物资运输和人员往来的情报。慕容闻是上海帮会中控制航运的老大，虽然表面已经退休，住在公共租界里休养，但其实私下也不得不与找上门来的日本人周旋。
秦文廉为保身家性命，将签订好的卖国协议拍了一卷胶卷备份放在公共租界里一家银行的保险箱里，将钥匙交到好友大法官郁国华手中。这又成为日本人和中共地下党争夺的焦点。
冯如泰绑架了秦文廉的女儿秦岚，以此威胁秦文廉交出协议密件。方滔去取密件时却发现了军统的人在跟踪他，他知道这是冯如泰在考验他。但此时他要想办法将拿到的东西送到江虹手中。
江虹发现秦文廉为了保命，交出了一份假协议密件。
冯如泰小组在执行刺杀另一个参与《日汪协议》谈判的汉奸梅思平时遭到日本人的伏击。只有方滔和女组员向非艳生存下来，二人都觉得内部有了叛徒。此时，江虹的诊所也遭到身份不明的人破坏，电台被毁，江虹在枪战中受伤被巡捕抓获。
为了在军统和中共两方证明自己的清白，方滔出生入死组装了电台。重庆方面要求他完成刺杀梅思平的任务以澄清自己；另一方面，他开始积极的营救江虹。
秦文廉要安排女儿偷偷的逃跑去国外，却走漏了消息，让日本人抓了回来。小泉觉得秦文廉已经不可靠了，便软禁了他一家。
方滔为了营救江虹去找了郁国华，郁国华因为此事被日本人杀害。临终前将秦文廉的保险箱钥匙托付给方滔，但钥匙却被小泉抢走。但是没有密码，小泉还是不能打开保险箱。
方滔在暗杀梅思平时发觉自己的计划总被日本人破坏，他经过试探才知道是向非艳将计划告诉了一个神秘人物。
方滔将计就计杀掉了梅思平。同时在慕容无瑕的帮助下也营救出了江虹。他向江虹汇报了秦文廉的《日汪协议》备份胶卷就藏在银行的保险箱里。
江虹决定由方滔来直接突破秦文廉。
方滔找到了秦文廉，秦文廉开出条件，要求营救他全家到安全的地方并且要拿到蒋介石颁发的特赦令，才肯交出协议密件。
小泉拿着保险箱的钥匙也逼迫秦文廉打开保险箱，但秦文廉只说里边是个人财产拒绝透露密码，对小泉采用应付拖延的策略。
同时方滔设计引出了向非艳背后的神秘人物，竟然是假死的冯如泰。原来冯如泰被小泉抓获，秘密投靠了日本人，他安排了军统行动组的全军覆没，但他一直怀疑方滔是共产党，留着方滔挖出了江虹的身份和中共的电台。
江虹为了帮助方滔拿到蒋介石的特赦令英勇牺牲。
方滔设计诱杀了冯如泰，铲除了军统中的叛徒。
方滔为营救秦文廉一家，打算在公共租界与日占区交界处挖一条地道。成功营救了秦文廉一家。