《神医将军》分集剧情介绍（1-33全集）大结局
虎旗军所在的泰山敖来峰上传来消息，剩余的虎旗军除了忍受瘟疫的折磨之外，还再次受到了保安团沉重的攻击。这让梁鼎山非常担忧山上的弟兄们，梁鼎山交代侯七、大片刀他不在之后一定听王怀远的指挥，将王怀远带上山。梁鼎山趁王怀远不注意，打晕王怀远，独自去找田德贵换人。梁鼎山在虫草带着百会、涌泉走远之后，引爆手榴弹自杀。王怀远醒来得知梁鼎山所为，又愧疚又感激，把儿子托付给了赵化民之后跟大片刀、侯七准备奔赴敖来峰。
《神医将军》分集介绍：第九集
临行之前，侯七带着王怀远听从梁鼎山的遗言，在城外柳树下挖出了《火器医鉴》，王怀远对梁鼎山更加感激。
王怀远一行人赶往敖来峰，在路上遇到保安团的人正押解着谷子，王怀远指使毛驴故意闯祸，惹怒保安团的人，然后跟侯七等人制服他们，救下谷子，才得知敖来峰上的情况非常不乐观，缺粮少药。王怀远找跟谷子侯七打听了虎旗军主要人物的情况以及性情等情况，算是初步了解了，王怀远让侯七先行回山报告情况，他们再做打算。
在济南的田麦穗已经被田德贵严密监视起来了，赵化民与田麦穗将银杏转移到了别的院落休养，将百会和涌泉送去了烟台。刘丙财带人来搜，扑了个空。
到了泰安城，发现满城都是贴着捉王怀远等人的告示，王怀远找到曾给他治过病的警察局长，住到了他家里，从侯七那里了解虎旗军三位旗主的个性。
副旗主刁四暗地里与佐藤勾结。
侯七上山，带回去了梁鼎山已死的消息，众人都非常悲愤，尤其是冯一刀刁四等人，对王怀远更是心存成见，冯一刀让侯七带话给王怀远，他如果想上山想留在虎旗军，就先想办法在两天之内弄三千斤粮食上山，否则就坚决不承认王怀远，甚至会杀了他替总旗主报仇。侯七无奈又下山传话。
王怀远得到消息之后，并不觉得是在为难他，而是欣然接受，并且积极活动，王怀远又威逼利诱林局长，让他帮忙弄粮食。谷子等人疑惑堂堂警察局长为什么会帮虎旗军的忙，原来王怀远曾经给过林局长一个治不孕不育的方子，让他生了儿子，所以他很忌惮王怀远，自然愿意帮忙。王怀远的计划是，带着谷子等人劫持前去运粮的士兵，顺利抢到粮食，然后抢了独立旅的衣服换上大胆的带人带车上山。
《神医将军》分集介绍：第十集
山上的丁五、冯一刀等人已经守在山腰，王怀远那边一开枪，山上的人就一冲而下，打垮了保安团，成功将五千斤粮食运上了山。
王怀远成功将粮食运上山，但是冯一刀还是不承认他，于是提出要跟王怀远比试枪法，比试的方式也特别，是让人顶着银元打，刁四搞鬼给王怀远放了一个“臭子”，结果王怀远跟冯一刀还是都各打掉两块银元，王怀使出“甩针”，成功打掉最后一块银元，赢了冯一刀，但冯一刀还是不服他。