《代号蓝色行动》分集剧情介绍（1-19全集）大结局
韩丹红让肖克凡到一家酒吧找她，故意喝醉向肖克凡表白爱意，并偷偷把追踪器放入了肖克凡的口袋中，事后肖克凡将计就计，让于青蓝带着追踪器去白浪村东边码头，错误引导敌人。通过这次与韩丹红接触，肖克凡感觉她做这些事情也是逼不得已的，其实本质上并不坏。
罗杰通知卓雅盯住吴晓，防止他乘坐“巴比特”号轮船偷渡逃走。卓雅偷偷跟踪了接走吴晓的汽车，捡到从车上扔下的手机SIM卡，把卡内的信息全部转发给了邓峰，邓峰得到吴晓将会从舟山码头离开的信息，命令警队前往此地，终于顺利抓捕了吴晓。
《代号蓝色行动》分集介绍：第12集
粱凯莉和韩丹红很快知道吴晓被抓的消息，准备按照老规矩，杀掉吴晓来隐藏自己。梁凯莉觉察到韩丹红的微妙变化，预感到韩丹红很快会和自己划清界限。在监狱中的吴晓对于协助警方破案毫无用处，向肖克凡提供不了有价值的信息。邓峰决定先关押吴晓，用它引出珍珍。夜晚，肖克凡在纸上写着一个个的线索，想从中找出一些头绪。
富安边防大队长郭万全到清水镇吴镇长处打听村里外来人口的信息时，对卓雅的怀疑徒然上升，他向罗树新汇报了此事，要求盯住卓雅。罗树新请示邓峰后，邓峰让他先按兵不动，等抓到珍珍一切就会真相大白。肖克凡推断韩丹红和林香农都属于珍珍集团犯罪分子，预计放长线钓大鱼用他们俩引出“珍珍”。
徐涛接受邓峰指令被调入看守所里就职，秘密监督珍珍集团对吴晓的举动，争取打入偷渡集团内部。因任务对外保密，只有依依不舍得递交专业报告，离开了战斗多年的警队和一直牵挂自己的于青蓝，前往新的岗位。
卓雅在梁冠成的办公室内安装了摄像头还查到了很多人的身份资料，其中也包括疑似韩丹红父母的身份资料，马上把资料发给了自己的搭档罗杰，罗杰认为这些资料很可能成为一个策反韩丹红的突破口…….。
《代号蓝色行动》分集介绍：第13集
徐涛想多赚点钱准备和于青蓝的结婚，结果赌球反而输了两万，于青蓝知晓后十分生气。
卓雅的搭档罗杰来到中国协助卓雅办案，他此次化身为专做与中国运输生意的迈克尔，卓雅向梁冠成引荐了罗杰，梁冠成表示愿意与他的公司合作。迈克尔以运输公司代表的身份来到金石湾度假村时，梁冠成见两人十分亲近，找人故意拍摄了一些卓雅和迈克尔在一起时的亲密照片。
罗杰查出韩丹红的父母很可能是在二十多年前的偷渡事件中遇难的，韩丹红肯定对自己的身世还不了解，韩丹红是梁凯莉的养女又是偷渡集团的骨干人员，如果能够成功策反韩丹红，那么将会对破案很有帮助。
于青蓝和小董监视韩丹红时，发现林香农到过韩丹红的家里谈事情。韩丹红向林香农传达梁凯莉的命令，要求除掉监狱里的吴晓。之后林香农以林高义生日为由，委托徐涛给林高义带几本发律书，书上写有“书上有毒，木器浸毒，干掉吴晓”的暗语。不知情的徐涛把书转给了林高义，林高义接到命令后，躲避监狱看守人员在牙膏里下了毒，预谋杀掉吴晓。