《飞龙在天》分集剧情介绍（1-40全集）大结局
万里为了让飞龙认自己母亲的惠娘，带着飞龙去求永来让飞龙能见惠娘，永来对万里一阵侮辱嘲笑后，答应让惠娘与飞龙见面，惠娘见到飞龙表示自己不认识飞龙，至于在刑场为他求情，只是因为自己很同情他对玉红的爱，更不愿自己丈夫刚到台湾就造孽，杀人，才让飞龙误会，自己不会再这么做了。飞龙与万里离去，惠娘伤心。
《飞龙在天》分集介绍：第17集
众人劝飞龙，表示惠娘应是有苦衷的，众人更逗飞龙开心，明秀正与飞龙拉扯，玉红来到，一阵尴尬。万里为了阿雪不接受飞龙一事，与她发生争执。阿雪希望飞龙回到惠娘身边，但万里求阿雪收留飞龙，阿雪勉强答应，但不同意与他同桌吃饭。飞龙找飞虎，希望化解彼此心结，并且不让万里为难。飞虎开出条件，除非飞龙消失在玉红眼前，两人不欢而散。
万里带飞龙来逢春家道歉，并希望撮合飞龙与玉红之婚事，飞龙为免大家困扰，而玉红也能谅解，不急于一时，万里公开甄选副手协助练兵，此举引起飞虎心里极度不满。此时，玉树供出告密的人是他自己，飞虎逼玉树向万里等众人承认告密一事，以期得到副手一职。
《飞龙在天》分集介绍：第18集
飞虎逼玉树向万里等众人承认告密一事，以期得到副手一职。万里道出心目中人选即是他，但玉树生气飞虎为他自己着想不顾其面。公开遴选大赛时，飞虎率先打败飞龙，但众弟子一致支持飞龙出任副手，万里当众宣布，飞虎、阿雪气愤离开。飞虎与阿雪欲离家出走，抵制飞龙当副手一事。万里、飞龙等人前来挽留。阿雪开出条件，除非飞龙今后不喊万里爹，即留下来。万里不同意，阿雪母子含恨离去。
阿雪与飞虎离家出走后来到逢春家投靠。玉红前来忠义堂报告阿雪母子状况，飞龙希望玉红劝飞虎不要钻牛角尖，尽早回武馆。友煌发现明秀对飞龙依旧念念不忘，劝她别执迷不悟下去，接受他的爱，飞龙碰巧撞见，不明所以，明秀哭奔出房外。玉红担心明秀对飞龙旧情难了，前来找明秀谈，明秀承认喜欢飞龙，但不会和玉红抢飞龙，此时飞龙将明秀掉在自己房里的香包还给明秀，引起玉红误会，幸由天九、桂香等人劝解，玉红稍谅解。
《飞龙在天》分集介绍：第19集
台风来袭，阿雪担心忠义堂安危，此时飞龙也劝万里在台风来前将阿雪、飞虎母子接来。来到逢春家，阿雪见飞龙随行，便一肚子火，与万里发生冲突，气而飞奔出去，万里追出。阿雪奔出去后，到独木桥处，因风雨太大，不慎摔伤腿，幸由飞龙救回武馆。飞虎担心母亲，随后也赶到武馆探视，并劝阿雪留下休息养伤。
万里担心台风在民间造成灾情，分别派飞龙、飞虎至各地巡视灾情，因各地百姓来不及做防台风准备，灾情持续扩大。万里来到总兵府和永来商量，永来同意拿出五百两赈灾。在发放米粮时，杜直和失明的妹妹彩云前来领食物时，因米粮短少，彩云当场昏过去。万里便怀疑知州大人从中贪污，万里向巡府报告此事，巡府下令再拨三百两命万里办理赈灾一事。