《妙手仁心2》分集剧情介绍（1-40全集）大结局
佩英在律师楼巧遇孝忠，二人初感尴尬，但最后佩英主动向他打招呼，并关心他，孝忠感动。宁生虽知安生刻意躲避众仁，但仍鼓励他不要放弃。心妍被病人家属无理取闹，心情苦闷欲找至美倾诉，却没有找到，想起他曾说过的河马玩具，于是出外购买，并从玩具中得到启示。
《妙手仁心2》分集介绍：第二十八集 敏智被谣言所困
国柱为智美的话辗转反侧，欲找新月，不果。敏智移情别恋追求富家女慈，慈更劝他弃医从商，敏智婉拒。一少年在打机时突然中风，其父母十分担心，并互相指责不懂教养儿子。佳佳终于等到换肾机会，伊华既高兴又担心。大量针对敏智的传真发送至医院及各大传媒，敏智的病人们恐他受流言影响，纷纷取消手术，令他大感震怒，并猜想是至美所为。一妇人许太因婴儿夭折郁郁寡欢，却见潘太生了三胞胎，许太乘安生不察抱走其中一婴孩，安生发现后大惊失色。敏智终于知道是谁发放流言，却苦无证据指控他。敏智心神恍惚，在超级市场购物时无意中将糖果放在身上，更被控告偷窃，幸心妍替他保释。孝齐为医院的事故身心俱疲，雪芳上前开导。
许太终将小孩抱回医院，众人顿吁一口气。安生见众仁为了陪自己寻找许太而导致皮肤敏感，二人在山草药店中相遇，安生却不肯承认为他买药。敏智被判无罪，并知道已有证据起诉毁谤他的人，心情豁然开朗。敏智得悉至美为他发起全院联署证明自己的人格后，向他致谢。
《妙手仁心2》分集介绍：第二十九集 国柱与美君的神秘关系
国柱在电视台担任医学节目客座主持，大受欢迎，令他沾沾自喜。众人往酒吧消遣，离去时，至美主动送朗平回家，令心妍误会以为他逃避自己。国柱打长途电话找母亲毕芬妮，不果。美君代表病人控告医院疏忽，国柱公事公办的态度令美君生气，冲口说出二人已婚的事实，心妍与至美愕然。宁生为了勇明彻夜未眠，又向众仁请教用针炙的成效，众仁见状请缨替她分析资料。伊华从佳佳口中得知海天非常关心爱他，隐觉不妥。医院中各人尽心照顾及关心病人，而和平更与其中一富商建立友谊。至美从国柱口中证实了他与美君的关系，只感他对感情不负责任。
勇明约会宁生亦不忘接美君飞机，宁生看在眼里。国柱始终未能联络芬妮，原来她已悄悄回港，国柱回家方知她在家楼下等候多时。宁生与勇明接吻后突然提出分手，勇明不明所以。宁生为免安生知道自己跟勇明分手，到朗平家中过夜，两人促膝谈心时，无意中触痛朗平对国柱的感情。芬妮任性地收看深宵节目，电视机声浪更惹来其他住户投诉，气坏国柱。
《妙手仁心2》分集介绍：第三十集 新月的明信片
芬妮的天真热情性格，往往令国柱感到尴尬，至美却不以为然。勇明向美君请缨前往泰国找一重要证人Tony回港作证，美君甚为欣赏。富商之妻专程来港找和平晦气，指她导致其家变，孝齐下令和平放大假。孝齐一直误会海天对雪芳有意，其实海天的对象是伊华，雪芳乘机揶揄孝齐一番。国柱找不到芬妮，隐觉不妥，果然芬妮与一男子在街头起争执且受伤送院，众人知芬妮是国柱母亲，大感诧异。一少女林小薇因肝硬化需近亲捐肝才可救活，但其父母皆是肝炎带菌者不能捐赠，其母提出薇的弱智姊姊小云愿意捐出肝脏，心妍反对，美婷却提出相反意见，心妍不满。心妍与小云倾谈后，终被她所感动并同意替她做手术，更明白到自己处事太主观。